Sous le pontificat du Pape Jean-Paul II, elle a été béatifiée en 1980 et canonisée par le Pape Benoît XVI à la Basilique Saint-Pierre le 21 octobre 2012. Divers miracles et événements surnaturels sont attribués à son intercession.
Le 19 décembre 2011, le pape Benoît XVI a approuvé le deuxième miracle nécessaire à la canonisation de Kateri. Le miracle autorisé date de 2006, lorsqu'un jeune garçon de l'État de Washington a survécu à une grave bactérie carnivore. Les médecins ont été incapables d'arrêter la progression de la maladie par chirurgie et ont informé ses parents qu'il mourrait probablement. Le garçon a reçu le sacrement de l'onction des malades d'un prêtre catholique. Comme le garçon est à moitié indien Lummi, les parents ont dit avoir prié Tekakwitha pour l'intercession divine, tout comme leur famille et leurs amis, et un réseau étendu contacté par les camarades de classe de leur fils. Sœur Kateri Mitchell s'est rendue au chevet du garçon et a placé une relique de Tekakwitha, un fragment d'os, contre son corps et a prié avec ses parents. Le lendemain, l'infection a arrêté sa progression.